La sequía y las alta temperaturas son una seria amenaza para la supervivencia de la encina en la península ibérica. Por este motivo, investigadores de Ingeniería Forestal y Biología Molecular y Bioquímica de la Universidad de Córdoba tratan de encontrar marcadores moleculares que permitan discriminar aquellos genotipos resistentes a distintos tipos de estrés (sequía, frío, salinidad, hongos, etc.).
Asimismo, el equipo investigador ha realizado varios ensayos experimentales para investigar el control del hongo Phytophthora cinnamomi Rands, causante de la seca de encinas, así como la aplicación de tratamientos preventivos y curativos con el fertilizante fosfito.
La encina y el alcornoque son dos especies fundamentales en la dehesa, que conforma en la actualidad un sistema único no sólo en España sino también en Europa, por combinar la explotación tanto de recursos ganaderos como agrícolas y forestales.